2003-01-01から1年間の記事一覧
先日引っ越しをしました。郊外の一軒家です。仕事場までは車で5分くらいです。
あれから一年ですか。
http://bioinformatics.oupjournals.org/cgi/content/abstract/19/17/2176?etoc
http://www.genaris.co.jp/product/product_7.htm
こんな人だったのか。 http://www.osaka.jst-plaza.jp/sangakukan/
PHPが動くことが確認できたので、PukiWikiを導入した。こちらはすんなりいきました。これでローカルでPukiWikiを使える環境が手に入りました。
G5に導入した。 以前にも何度もトライしたのだが、は動くのに画像がかけなかったのです。実は、問題があったのはスクリプトのファイルの文字コードの問題でした。
職場のG5にeXodus（MacをX Windowのディスプレイサーバとするソフトウエア）というのが入っていることに気付いた。 http://www.dit.co.jp/powerlan/index.html
$image->dashedLine($x1,$y1,$x2,$y2,$color) $image->line($x1,$y1,$x2,$y2,$color) グラフを描くにはこの辺を使えばいいのかな。
http://member.nifty.ne.jp/hippo2000/perltips/podread.htm#2.
perlスクリプトの実行速度を分析するプロファイラ。http://yuri.sakura.ne.jp/〜propella/tips/Devel_DProf.html
とうとうやってきました。2GHzの速度とと2GBのメモリと。そして23インチCinema Displayも。速いというのはよいことです。
CGI, PHPをPB上で使えるようにした。
http://news.com.com/2100-1032-5091337.html http://www.publiclibraryofscience.org/サルの脳でロボット・アームを制御ってのもPLoSに掲載されたのですね。
びっくりした。
MS-DOS:¥r¥n" -> UNIX"¥n" perl -p -e 's/¥r//' outfile Mac:"¥r¥n" -> UNIX:"¥n" perl -p -e 's/¥r¥n/' outfile 昔教えてもらったことがある。忘れていたのでメモ。
MLで紹介されていたページ。 http://www.cbrc.jp/cbrc/intro/intro_pol.ja.html 特許の話だけでなくて日本のBioinfo全体の現状が書かれている。是非はともかく、Bioinfo研究者の個人評価についての話など興味深い。
手に入れる予定。Apple USAのページで発売日がカウントダウンされている。 http://www.apple.com/
カタログがPDFで手に入ります。 http://www.oreilly.co.jp/ 印刷版は無料送付してくれます。日本国内だけだよねえ？
研究室用に数台購入したG5を担当部署でまとめて設定(ソフトウェアインストールとかOSアップデートとか、バックアップ設定とかかな？）している最中だそうだ。Be patient...
先週、箱が積まれているのを見たんだけどなあ。自分から言わないと持ってきてくれないのかなあ。
I saw boxes for G5 in front of computer office of our group. At last!
PerlでGD（グラフィックライブラリ）を使うためのモジュール。 http://stein.cshl.org/WWW/software/GD/
SVGとかSVGGraphっていうのはどうだろう。
EMBOSSには、いろいろなツールが用意されているみたいだけど、これを使えば解析した結果のグラフィック表示もできるのでしょうか。以前にインストールしようとしたことがあるけれど、少しさわっただけで放ってある。
解析した結果が正しいのか検討する時に、公共のViewerを使っているのですが、今日はそのサーバーが調子悪いらしくアクセスできません。うーむ。 いずれ解析結果を自分でグラフィック表示する必要が出てきそうなので少し調べてみました。
ステップのひとつにDNA配列中のLongest ORFを見つける処理があったのですが、これに思っていたよりも手こずりました。はじめにおおまかな処理の流れを決めてから書きはじめたのですが、なかなか思うように動きません。一度完成したと思っても、実際のデータ…
しばらくの間、入門書の勉強をとめて、実践的なスクリプトを書いていました。一連のステップを含んだ300行ほどのプログラムです。これでとりあえずの目標としていた処理ができるようになります。
Perlを勉強しはじめた時にI氏に「もう少し立つと便利になるよ」といわれてもらった本です。 で、今この本を使えるようになってきました。最近、教科書だけではなく、実際のデータを処理するためのスクリプトを書くことをはじめています。また、他の人の書い…
