Body Map

http://bodymap.ims.u-tokyo.ac.jp/
Humanおよびmouseのcell lineからmRNAを集めて3'端の配列を調べる。
例えば、Select genes by expressionでCD4とCD8だけで発現しているクローンを検索してみると50個ほどのクラスタがヒット。そのうち8個はDescriptionが記述されている。

• CD4+CD8+の遺伝子ってもっとたくさん知られているのでは？？
  • CD4とCD8のみで発現している遺伝子ってのはこんなものか。
  • CD4とCD8以外の発現はどちらでもよい、っていう検索をするには、全部クリックしないといけないのか？これ面倒だ。
  • Normalizeしてないから、発現量の多いものしか検出できない？
• 50個中8個しかdescriptionがついていないのはなんで？
  • 配列が短すぎて既知の遺伝子にヒットしないか、特定できない？
  • データが更新されてない？（違うよな）

• ヒトではCell lineを中心にしているようだ。臓器からも取っているようだが。臓器とかから直接mRNAをとるのは難しいからか。

だからマウスで補っているのか。