2004-01-01から1年間の記事一覧

GDのインストール。Help me!

ええっと、Finkを使って、gd-pmをインストールしました。 webからGDモジュールを使うperlプログラムを呼び出すと以下のエラーが出ています。Can't locate GD.pm in @INC (@INC contains: /System/Library/Perl/darwin /System/Library/Perl /Library/Perl/da…

 G5

com

インストールしたOSは10.2.8。 必要なアプリやデータをひとつづつ移しています。何個か入れては再起動して、立ち上がることを確認しています。今のところ動いています。

 G5の復旧

com

G5に完全にデータを元の位置に戻すと、また同じことになる可能性があるので、OSをクリーンインストールして、データは別のディスクにキープしてもらうことにしました。故障の原因とは関係ないのかもしれませんが、先週作った400万個の配列ファイルが入ったフ…

[com] 再度、boot不可能に。

再起動したら、また立ち上がらなくなってしまいました。アップルマークが出たままでシステムを読み込まず。なんてこった。現在、firewire接続したハードディスクからブートし、検査中。原因を追及しないと同じことが起こりうるということ。この書き込みは、…

新しいマシンへの移行

com

結局、G5はマザーボードとハードディスクの両方がdamageを受けているらしいとの判断。2日かけてハードディスクのデータを吸い出し、新しいマシンに移してもらいました。新しいといっても同じG5ですが。ついでにPantherにupgradeしてもらいました。ホームデ…

近況

二週間以上更新していませんでしたね。先週はプログラム書きで忙しく。そして今週はコンピュータが壊れてしまい。月曜日の朝G5を再起動したら、立ち上がらなくなってしまいました。どうもハードディスクが故障したようで、予想したよりも重傷。現在死にかけ…

ML

あれは何を言いたいのかよくわからない。どういう論理なのか。

TrackBack

kwg memo(http://d.hatena.ne.jp/kwg/20040128)を参考に外部TrackBackを送信してみましたた。まず、下記のサイト http://d.hatena.ne.jp/jouno/20030414#1050318251 にあるhtmlをローカルで作成し、ブラウザで開きました。記事のurlと相手の記事の trackba…

CDSの記述方法

CDSという言葉は国際塩基データベースで使われている言葉です。彼等の書き方によれば、5'truncateなら、必ず と記述します。フレームをcodon_startというQualifierを使い例えば下記のように表します。 /codon_start=3 これを人間の言葉で書くと「CDSの領域は…

doc

自分から募集しておいて、申し込みを受け取った旨の返事もないなんて相手に対して失礼だ、などと思うことはありませんか。

 バックアップ

今週初め頃、コンピュータのデータの一部を誤って消してしまいました。OSXのTerminal上から作業していたつもりとは別のシェル上でrm -R *とうってしまい。消えたのはホームディレクトリのDocuments、Library、Desktop、MoviesやPicturesなど。幸い主な重要デ…

テスト、http://d.hatena.ne.jp/multi/20040304』

バッククォート演算子

perlスクリプト上からコマンドを実行することができる。systemコマンドと違って標準エラー出力を返さない。

FindBin

実行プログラムのディレクトリを@INCに加える方法。 use FindBin qw($Bin); use lib "$Bin/"; これで、他のディレクトリからあるプログラムを実行させる場合に、同じディレクトリにあるモジュールやプログラムを動かせるようだ。これを使うことによるSecurit…

石崎先生

(Gardenerさんの日記から) http://www.sgtpepper.net/garden/diary/?date=20040228 石崎宏矩先生は私の学部時代の恩師です。bombyxinの遺伝子発現に関する実験を行わせてもらいました。あれからもう10年になりますね。

先週末、上の階で工事をしていて、騒音が激しいのでPowerbookを調達してもらい、別の部屋へ避難。そこから自分のMac (Desktop)にアクセスして仕事していました。terminalからSSHとFinderの「サーバへ接続」で一応仕事はできたのですが、GUIで遠隔操作するこ…

自らの手で除霊することにしました。うまく行けば少なくとも私は除霊されるでしょう。

カテゴリー

日記のカテゴリー分けってどうやってやるんだろう、って思ってたけど、はてなに(tdiaryに?)元々ついている機能だった。なんだあ、括弧つけるだけでいいのか。 *と括弧がついたkeywordを含む日記を検索するようになっているのですね。pukiwikiを使った日…

微生物学 : 鉄を腐食させる海洋微生物

Nature February 26, 2004 http://www.natureasia.com/japan/nature/updates/index.php?id=581&issue=6977 「鉄を腐食させる新しい細菌株が同定された。この微生物は海底堆積物中に生息し、工業上生じる酸素の低い環境における鉄の腐食に対する、これまで知…

HIVを死滅させるタンパク質、サルの細胞内に発見

http://www.excite.co.jp/News/computers/20040227173000/0227.Technology20040227305.html http://www.natureasia.com/japan/nature/updates/index.php?id=580&issue=6977 「HIVがサルの健康な細胞に入り込み、遺伝子を保護する殻を脱ぎ捨てようとすると、…

BLAT

手元ののmacでBLATのgfServerが動くようにしてみた。マウスゲノムのデータに対してcDNAの配列を検索しているのですが快適に動きます。BLATって、ゲノムだけじゃなくて例えばdbESTのデータに対して検索する場合でも使える(早さとか精度とか)のでしょうか。

MOBLOG

Mobile Blogね。 http://blog.neoteny.com/minami/archives/003286.html カメラ付携帯電話の普及している日本だからこそ可能性のある分野だね。

RNAi

すごいね。 http://www.nature.com/focus/rnai/animations/

Trackback

とらっくばっくってどうやるの?はてなでもできるの?はてなの「日記のリンク元」っていうのはTrackbackなの?

はてな

はてなの事務所が京都から東京に移転するんだそうだ。全サーバー移動のため4月10日、11日はサービス停止だそうです。

cDNA配列

国際塩基配列データベース(GenBank/EMBL/DDBJ)にあるcDNA配列を見ていると、時々変わった配列を見かける。ちなみに特定のプロジェクトに限った話ではない。例えば、cDNAの配列が逆転(相補鎖)して登録されているらしきものや、イントロンを含むものなど。先…

RNAポリメラーゼ反応

これ面白い。 http://www.nig.ac.jp/museum/dataroom/transcription/06/movie.html

Functional Genomics

とは何?ひとつひとつの遺伝子やタンパク質を研究するのではなく、全ての遺伝子やタンパク質を対象とする学問のこと?ある現象に関わるあらゆる分子群(遺伝子やタンパク質を含む)を対象にする学問のこと?

一個の脳細胞でひげは動く

http://www.natureasia.com/japan/nature/updates/index.php?id=577&issue=6976

Fビューア

にアクセスできなかったので、問い合わせようとメールを書いていたら、アクセスできるようになった。こちらの問題だったのだろうか。